该衙门隶属御史台，是监督巡江部队履职情况的部门。虽然此时阮大铖为兵部右侍郎专管巡江事宜，放任手下在长江沿岸敲诈勒索，其他人多不敢言。但弘光朝左都御史刘宗周、右都御史祁彪佳皆以敢直言著称。虽然左都御史刘宗周被马士英排挤出朝，祁彪佳初掌台阁，让小有名气的御史顾杲在扬州任所监督巡江水师。这顾杲新官上任三把火，常到江边巡查。
这天，正带人来到江边，就看见岸边多人打成一团，命人上前询问是怎么回事。阮小小见是御史台的人，便恶人先告状，把丁北宁他们不服从检查反而殴打巡江士兵之事讲了一遍。
顾杲黑着脸，命人将丁北宁等带到跟前，问其可知罪否。
丁北宁不慌不忙，出示了朝廷诏命，把事情讲述一遍。最后，一把拉住阮小小，指着其荷包说，此乃其敲诈一位商人的贿赂银子。
阮小小未料到刚才收受贿银被人瞧见，哪里肯承认。丁宁指认的那位商人被带到御史跟前，吓得说了实话。并说，自己新铸的这批银锭都有特殊记号，是到江南买米专用的。
顾杲让人比对贿银与商人的银子，发现确实是一批，而其他银子决无此记号。于是，命人将阮小小上了脚镣手铐，带了脏银，同丁宁一起过江直奔南京。当晚，即将阮小小交到了御史台牢房。
翌日，祁彪佳即参奏阮大铖罔顾法纪，纵容族人手下为非作歹，且对朝廷褒奖的忠贞侯骨骸有大不敬之罪，并把一干口供证词呈上。
阮大铖被打了个措手不及，只好当廷谢罪，表示要严惩不贷。
马士英刚刚排挤走了刘宗周，不想祁彪佳又蹦出来与自己一党作对。只是阮大铖被人揪住了小辫子，只得象征性的责备一番，让其带回去严加管教。
高弘图出班参奏，国有国法，军有军规。阮小小身为军官，玩忽职守，勒索行商，如不惩处，江防巡守形同虚设。应该让有司依法治罪，而不是带回阮府私自释放。同时，应追究阮大铖纵容之罪。
明安宗不想因为一点小事影响内阁和御史台关系，当廷命令有司对阮小小以律治罪，并对阮大铖罚俸三月，以示惩戒。然后，指示礼部对忠贞侯唐过以礼安葬。
高弘图再次动本，将左懋第奏章呈上，禀报了丁北宁获得此奏章经过，说此前独自归来的陈洪范有通敌嫌疑，应该收监治罪。
弘光帝见清廷对此事反应平平，一腔联虏希望化为乌有。他看了马士英一眼，问道：“马爱卿，陈洪范之事怎么说？”
马士英出班跪倒：“臣启万岁，陈洪范孤身归来之后，微臣便先有三分怀疑，已经勒令其闭门思过，不得四处周游滥发谬论。但以一位正使不确定的判断治一位副使之罪，似乎有些草率，伏乞圣裁。”
弘光帝略一沉吟，道：“既然马爱卿已经令其闭门思过，可以暂且如此。将来如果有了新的罪证，一体治罪。”
高弘图见弘光帝对马士英之流一味包庇纵容，青红不分，皂白不辨，便恳请辞朝归里。弘光帝考虑到姜日广刚刚辞职，便再三挽留。
却说阮大铖满面羞惭，下朝归去，找人查问阮小小之事，得知了事情经过，对御史台的祁彪佳、顾杲及丁北宁恨之入骨，发誓将来一定报复。
阮大铖，字集之，号圆海，安徽枞阳人，历史上有名的奸佞，却又是享誉全国的诗人、才子、戏曲名作家。其明朝万历四十四年与另一奸臣马士英同榜中进士。当时，东林党如日中天。阮大铖通过与东林党领袖左光斗的同乡关系，依附东林党，是为高攀龙的弟子。在与阉党的斗争中曾经赤膊上阵，被称为“没遮拦”，成了东林党的骨干。因此，受到阉党的攻击，仕途很不顺利。
天启四年春天，吏部给事中出缺，左光斗通知阮大铖到京候任。此刻，因为赵南星、高攀龙、杨涟与左光斗发生矛盾，用“以察典禁，大铖不可用”为由，改用高的另一弟子魏大中。阮大铖到京时，赵南星令改任工部任给事中。阮大铖心中相当失落，吏部排序第一，给事中油水很大，而工部则相当于清水衙门。
此刻，阉党的魏忠贤出现了，说如果投靠我们，保你如愿。阮大铖为利益吸引，投靠魏忠贤，得遂心愿，任吏部给事中。
这一下，东林党大哗，发动了对叛徒的全面攻击。阮大铖不堪压力，上任不久就辞职回乡，从此，和东林党决裂。
魏忠贤当道时，阮大铖被召回京城，擢升太常寺少卿，并认在魏忠贤膝下当干儿子。此时，其好友马士英因事获罪，阮大铖出手相救，二人遂成莫逆之交。
崇祯登基，魏忠贤事败，阮大铖准备了两个版本的奏章，一起送到朋友杨维垣处，让其见机行事，看东林和阉党哪一方能在新帝面前得宠，就弹劾势弱的一方。此时，杨维垣正和东林党作对，就把其弹劾东林党的奏章交了上去。后来，阮大铖名列逆案，在崇祯朝未能得官。不过，受过其恩惠的马士英却混得风生水起，官居督抚。
阮大铖回到南京，在库司房买了豪宅，在城郊修建别墅，致力于戏曲创作，并成立了阮家班剧社，以演唱自己创作的剧目为主，先后写作演出了《燕子笺》、《春灯谜》、《牟尼合》、《双金榜》等，遍请江南名士欣赏，并千方百计想弥合与东林党的裂痕。
阮大铖在政坛上声名狼藉，被称为小人中的小人。虽然其后来官居兵部尚书，东阁殿大学士，却藏污纳垢，贪污受贿，大兴党狱，疯狂迫害东林党和复社人士。但在文学造诣上却登峰造极，有人称其是“有明一代唯一之诗人”，说其戏曲“出出精彩，幕幕精彩，句句精彩。”
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